Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx1P81068 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms