Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms