Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps11P62281 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rps11P62281 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms