Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3eP60229 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms