Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms