Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rp1P56716 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rp1P56716 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rp1P56716 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms