Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms