Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms