Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GemP55041 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GemP55041 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GemP55041 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GemP55041 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GemP55041 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GemP55041 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms