Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PctpP53808 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PctpP53808 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms