Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lbx1P52955 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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