Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2e3P52483 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e3P52483 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e3P52483 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms