Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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