Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms