Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VdrP48281 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VdrP48281 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VdrP48281 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VdrP48281 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms