Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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