Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rph3aP47708 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3aP47708 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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