Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms