Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps26aP40336 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms