Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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HmgclP38060 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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