Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs1P35441 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms