Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms