Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp4P35123 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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