Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa2P31245 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms