Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk4P30285 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk4P30285 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms