Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp3P28862 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp3P28862 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms