Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms