Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrbP28704 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RxrbP28704 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RxrbP28704 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms