Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atxn10P28658 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms