Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aco1P28271 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aco1P28271 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms