Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms