Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psmb9P28076 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psmb9P28076 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms