Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vav1P27870 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms