Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lef1P27782 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lef1P27782 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms