Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RdxP26043 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RdxP26043 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RdxP26043 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RdxP26043 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms