Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms