Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms