Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PcnaP17918 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PcnaP17918 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms