Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmga1P17095 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmga1P17095 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms