Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf2P16951 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf2P16951 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf2P16951 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms