Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd44P15379 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms