Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms