Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DmdP11531 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DmdP11531 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DmdP11531 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DmdP11531 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms