Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifna9P09235 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms