Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb7P09024 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb7P09024 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms