Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifna4P07351 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms