Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01740 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01740 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01740 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01740 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01740 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01740 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms