Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01673 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01673 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01673 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01673 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01673 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01673 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms