Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01672 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01672 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01672 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01672 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01672 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01672 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms