Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sypl2O89104 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms